进入宜家,湖南犹如进入迷宫。
通过对病毒不同蛋白对应的RNA结构与翻译速率以及病毒亚基因组表达量的关联分析,月易结作者发现RNA结构会影响病毒亚基因组的表达量以及蛋白的表达量。在这项工作中,日电作者利用细胞内新冠病毒RNA结构,通过PrismNet模型预测了42个与新冠RNA相互作用的宿主蛋白。
新冠病毒RNA结构解析,力交保守RNA结构鉴定,力交互作宿主蛋白发现以及抗病毒药物筛选无论是新冠肺炎(COVID-19)、非典(SARS)、还是中东呼吸综合征(MERS),其病原体都是单链RNA病毒。利用多种新冠病毒细胞培养模型,湖南作者在不同细胞内验证了多种重定位药物能有效抑制新冠病毒复制,为抗新冠药物的开发提供了一个新的思路。月易结新型冠状病毒(SARS-CoV-2)是造成全世界新冠肺炎大流行的罪魁祸首。
新冠肺炎疫情爆发之后,日电张强锋课题组与协和医学院王建伟课题组以及清华大学医学院丁强课题组迅速行动,日电在之前研究基础上,不仅解析了新冠及其相关病毒的RNA结构,还利用新开发的深度学习模型PrismNet,尝试从新的角度寻找有效的抗病毒药物。病毒RNA会折叠成复杂的RNA结构,力交在病毒的生命过程调控中起重要作用。
在张强锋课题组另外一个工作中,湖南他们通过整合细胞内RNA结构信息,利用深度学习算法构建了预测RNA结合蛋白-RNA相互作用的PrismNet模型【2】。
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